BioSolvetIT infiniSee 是您的化學(xué)空間導(dǎo)航平臺。基于相似性,英菲尼發(fā)現(xiàn)分子感興趣的篩選庫或化學(xué)空間的無限大。給予模板或查詢分子,英菲尼的返回出人意料的相似分子.BioSolveIT infiniSee是一款強(qiáng)大的分子對接軟件，它用于預(yù)測小分子和生物大分子之間的相互作用。這種相互作用通常在藥物發(fā)現(xiàn)和設(shè)計(jì)過程中進(jìn)行預(yù)測和分析。infiniSee使用先進(jìn)的分子對接算法，可以快速、準(zhǔn)確地預(yù)測小分子和生物大分子之間的相互作用。它支持多種輸入格式，包括PDB、SMILES和分子網(wǎng)絡(luò)等。此外，該軟件還具有強(qiáng)大的可視化功能，可以直觀地顯示小分子和生物大分子之間的相互作用，從而幫助研究人員更好地理解藥物與目標(biāo)蛋白之間的相互作用。

在使用infiniSee時(shí)，用戶需要提供小分子和生物大分子的結(jié)構(gòu)信息，并選擇適當(dāng)?shù)膶铀惴ê蛥?shù)。然后，軟件將執(zhí)行對接實(shí)驗(yàn)并生成結(jié)果報(bào)告，包括小分子和生物大分子之間的相互作用細(xì)節(jié)、能量分析和動(dòng)力學(xué)模擬等。這些結(jié)果可以幫助研究人員更好地理解藥物與目標(biāo)蛋白之間的相互作用，從而優(yōu)化藥物設(shè)計(jì)和開發(fā)?？傊?，BioSolveIT的infiniSee是一款強(qiáng)大的分子對接軟件，它可以幫助研究人員快速、準(zhǔn)確地預(yù)測小分子和生物大分子之間的相互作用，從而優(yōu)化藥物設(shè)計(jì)和開發(fā)。

今天腳本之家小編給大家分享的是BioSolvetIT infiniSee的免費(fèi)版本，下面有詳細(xì)的安裝注冊教程，需要的朋友不要錯(cuò)過哦！

安裝教程

1.在腳本之家下載解壓后，大家將獲得infinisee-5.1.0-Win64.exe和crack等文件，雙擊infinisee-5.1.0-Win64.exe開始安裝軟件；點(diǎn)擊browse更換軟件安裝目錄，默認(rèn)目錄：C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\BioSolveIT\infiniSee-5.1.0；如圖

2.默認(rèn)選擇，點(diǎn)擊next，如圖

3.默認(rèn)選擇，點(diǎn)擊next，如圖

4.等待安裝完成即可，如圖

5.點(diǎn)擊install開始安裝軟件，如圖

6.去掉運(yùn)行軟件的勾選，先不要運(yùn)行軟件，如圖

7.在安裝補(bǔ)丁前，首先要打開軟件的安裝目錄，如果忘記軟件的安裝目錄，請返回到桌面，找到軟件的桌面快捷圖標(biāo)，并右鍵點(diǎn)擊圖標(biāo)，出現(xiàn)彈窗后選擇“打開文件位置”即可獲得文件安裝目錄。如圖

8.打開crack文件，將里面的文件復(fù)制到軟件安裝目錄中替換，如圖

9.選擇替換目標(biāo)中的文件，如圖

10.安裝激活完成，如圖

軟件簡介

讓我們先做一個(gè)思考實(shí)驗(yàn):如果你在奧運(yùn)會大小的游泳池里裝滿沙子,你需要一個(gè)大約1,000,000,000杯咖啡。這個(gè)體積大約含有1013粒沙粒?，F(xiàn)在,想想這些沙粒代表可能的藥物候選人,你正在尋找一個(gè)黃金分子。高通量虛擬篩選通常涉及大約5到1千萬種化合物,這與在5到10杯沙子中尋找一種特定的顆粒是相同的。但是誰能保證完美的分子在你從泳池里取出的5-10個(gè)杯子中的一個(gè)呢?可能性最多也就是一百萬分之一。..如果你能在整個(gè)游泳池甚至數(shù)以千計(jì)的游泳池中搜索,難道不是更好、更有希望嗎?

功能特色

發(fā)現(xiàn)看不見的可能性

在1014個(gè)結(jié)構(gòu)和更多的前所未有的大空間中找到分子,或者在你自己的內(nèi)部庫中搜尋活躍分子。

相似之處

查詢和點(diǎn)擊分子之間的相似性是令人愉快的可視化,你可以毫不費(fèi)力地選擇化合物。英菲尼將向你展示為什么它認(rèn)為某些東西是相同的。

鄰居與遙遠(yuǎn)的鄰居在一起

我的復(fù)合庫有趣的腳手架跳。在一見鐘情中發(fā)現(xiàn)了距離遙遠(yuǎn)的分子,但在化學(xué)和基于藥物的作用中非常接近。

無限的可獲得性

幾天內(nèi)從虛擬到小瓶!只有極有可能在實(shí)驗(yàn)室中形成的東西才會在英菲尼的化學(xué)空間導(dǎo)航中提出。與我們的合作伙伴合作,可以在幾周內(nèi)提供所需的點(diǎn)擊率。

找出隱藏的相似之處

有了英菲尼,你終于可以比較蘋果和桔子了。英菲尼的基本概念非常簡單:我們不是搜索已經(jīng)"組裝"的分子,而是從"碎片"中組合合成化合物。碎片的來源可以是組合庫,也可以是任何產(chǎn)生碎片的過程。英菲尼打開了通過相似性搜索技術(shù)篩選數(shù)十億種化合物的可能性,方法是在廣闊的化學(xué)空間中導(dǎo)航,并搜索一個(gè)查詢分子的遠(yuǎn)鄰。結(jié)果通常在不到一分鐘的時(shí)間內(nèi)就會在標(biāo)準(zhǔn)筆記本電腦上發(fā)布。您可以選擇定義模糊的藥物,以增加支架的多樣性,或要求重要的分子結(jié)構(gòu)在點(diǎn)擊。

你的分子可以在任何地方

英菲尼斯特巧妙的扭轉(zhuǎn)不僅是在巨大的化學(xué)空間中進(jìn)行搜索的可能性,而且是在不同來源的空間中搜尋的可能性。不同空間的相同結(jié)構(gòu)的數(shù)目極低(萊塞爾等人)。由于空間的設(shè)計(jì)和設(shè)置,以及所使用的建筑物的多樣性。不管你的內(nèi)部庫有多大,也不管你獲得了多少化合物來添加,它只會是你的化學(xué)家合成能力的一小部分。涉及不同的化學(xué)空間增加了你找到你本來會錯(cuò)過的分子的機(jī)會。

速藍(lán)色

以前所未有的速度穿越廣闊的化學(xué)空間。

視覺藍(lán)色

用直覺的色彩編碼,在一睹中理解相似性。

易藍(lán)的

自我解釋接口。簡單地拖動(dòng)您的查詢并開始。

更新說明

與貝姆斯-穆爾克科腳手架和骨架的復(fù)合聚類: 在分析器模式中引入了Bemis-Murcko支架生成方法,通過將數(shù)據(jù)抽象到分子及其核心結(jié)構(gòu)之間的關(guān)系,快速簡化了大型數(shù)據(jù)集。計(jì)算了兩種表示形式,即Bemis-Murcko支架和骨架。

腳手架和骨架既可以在單個(gè)分子上產(chǎn)生,也可以在分析器模式表中的一組被檢查的分子上產(chǎn)生:

在單個(gè)分子上,右擊分子入口,然后單擊相應(yīng)的支架/骨架計(jì)算選項(xiàng)。

對于多個(gè)檢查過的分子,將使用新引入的"檢查過的分子計(jì)算"工具欄按鈕,并選擇適當(dāng)?shù)倪x項(xiàng)。

基于支架或骨架的分子分組可以在數(shù)據(jù)面板中通過在"可視化"下拉菜單下引入的多個(gè)新選項(xiàng)中選擇一個(gè)來完成。

有關(guān)貝姆斯-穆爾科腳手架和骨架的信息也包含在從英菲尼塞導(dǎo)出的elel、CSV和Sdf文件中。

網(wǎng)格視圖現(xiàn)在是支架、骨架和試劑可視化的默認(rèn)值。

單一或多個(gè)檢查過的腳手架/骨架可用作過濾器,將數(shù)據(jù)縮小到僅包含特定腳手架或骨架的數(shù)據(jù)。

在單個(gè)條目上,右擊腳手架/骨架條目,然后單擊"創(chuàng)建過濾器"選項(xiàng),最后確認(rèn)篩選器面板中的篩選參數(shù)。

對于多個(gè)檢查過的條目,單擊數(shù)據(jù)面板左上角的篩選按鈕,將選擇檢查過的條目作為篩選參數(shù)。根據(jù)選定的條目設(shè)置篩選器在篩選器面板中按慣例進(jìn)行。

增強(qiáng)模擬獵人: 模擬搜索現(xiàn)在還生成了二維面板上的查詢結(jié)果匹配圖像,提供了相似性的視覺和直觀指示。

模擬獵手中的查詢現(xiàn)在可以包含宏觀循環(huán),只要搜索的化學(xué)空間中含有具有宏觀循環(huán)的化合物,就會提供有意義的結(jié)果。 注: 生物分子提供的化學(xué)空間不包含有大循環(huán)的分子,但是如果用戶用大循環(huán)創(chuàng)造自己的空間,那么相應(yīng)的結(jié)果就應(yīng)該被發(fā)現(xiàn)。此外,支架料斗仍然不能接受大循環(huán)分子作為輸入。

具有宏觀循環(huán)的分子也可以被加載到分析器模式中進(jìn)行進(jìn)一步的處理。

更快的腳手架斗和模擬獵人搜索: 在腳手架料斗中的搜索現(xiàn)在比以前更快,這是因?yàn)橄旅娴母黄姘姹緩?.9更新到6.10。

通過模擬獵手進(jìn)行的近距離模擬搜索現(xiàn)在比以前快得多,這是因?yàn)榭臻g光算法從1.1版更新到1.2版。

新模式預(yù)覽,模式選擇器行為: 一個(gè)新的搜索模式的無功能預(yù)覽 "主題組合者" 用于超大組合化學(xué)空間的子結(jié)構(gòu)搜索。

模式選擇器面板現(xiàn)在根據(jù)用戶設(shè)置的屏幕大小或英菲尼塞窗口的大小動(dòng)態(tài)調(diào)整大小。

供應(yīng)商特有的分子分組和過濾: 現(xiàn)在可以根據(jù)相應(yīng)的供應(yīng)商使用數(shù)據(jù)面板中的"供應(yīng)商的分子"下拉菜單項(xiàng)對分析器中來自支架斗或模擬獵手搜索的分子進(jìn)行分組。

復(fù)合供應(yīng)商可以作為篩選標(biāo)準(zhǔn),以縮小分析器模式中的數(shù)據(jù)范圍,僅限于那些由用戶選擇的供應(yīng)商。

試劑可視化網(wǎng)格視圖: 除了表視圖之外,為了有效地利用篩選一個(gè)化學(xué)空間,在"分子按試劑"菜單項(xiàng)下介紹了分析器模式數(shù)據(jù)面板中試劑的網(wǎng)格視圖。

加強(qiáng)對計(jì)算的控制: 在系統(tǒng)設(shè)置中,引入了一個(gè)新的"計(jì)算"選項(xiàng)(類似于SEEES)。

用戶可以決定他們是否希望在下列工作流程下自動(dòng)計(jì)算出Bemis-Morcko腳手架/骨架和優(yōu)化屬性:

從文件中裝載分子

從搜索模式向分析器添加分子

改進(jìn)與直方圖的相互作用: 使用直方圖框作為篩選標(biāo)準(zhǔn)現(xiàn)在額外的可能性與右擊在垃圾箱上。

拿著換檔鍵,選擇兩個(gè)不相鄰的垃圾箱,選擇范圍內(nèi)的所有垃圾箱作為過濾器。

鍵盤快捷鍵: 在數(shù)據(jù)面板中檢查和取消檢查項(xiàng)現(xiàn)在可以使用ALT+C鍵盤快捷鍵。這種快捷方式對表格和網(wǎng)格視圖都有效

通知行為的變化: 從英菲尼版本5.1,只有關(guān)鍵通知(帶有紅色背景)將保留在屏幕上供用戶操作。

所有其他非臨界通知(橙色背景)和信息(藍(lán)色背景)在屏幕上顯示一段短時(shí)間后,將會折疊到消息中心堆棧中。

雜項(xiàng)變動(dòng):

在分析器模式下,指向數(shù)據(jù)面板中"選擇可視化"下拉菜單的泡沫幫助現(xiàn)在只在分析器表中有數(shù)據(jù)時(shí)顯示。

參數(shù)#立體聲中心和#立體聲鍵已從分析器模式中刪除。

腳手架料斗生成的查詢結(jié)果匹配圖像將不包含在二維面板顯示的全局相似性。

如果用戶選擇的保存或創(chuàng)建項(xiàng)目的位置缺乏書面訪問,則顯示了信息錯(cuò)誤消息。

當(dāng)一個(gè)無效的許可證文件被拖放時(shí),啟動(dòng)屏幕現(xiàn)在提供清晰的視覺反饋