R語言數(shù)可視化Split?violin?plot小提琴圖繪制方法
更新時間：2022年02月17日 14:37:43 作者：黃小仙
這篇文章主要為大家介紹了R語言數(shù)可視化Split?violin?plot小提琴圖繪制方法，有需要的朋友可以借鑒參考下，希望能夠有所幫助，祝大家多多進步
最近小仙同學在好幾篇文獻里看到了這種小提琴圖，暫時就膚淺地認為這是作者為了更好地比較對照組與實驗組的差別，所以將同一個基因的小提琴圖各畫了一半，放在一起。為了跟上可視化的潮流，小仙也來嘗試畫一下這個沒查到正經(jīng)名字的圖。
Step1. 繪圖數(shù)據(jù)的準備
首先要把你想要繪圖的數(shù)據(jù)調(diào)整成R語言可以識別的格式，建議大家在excel中保存成csv格式。
作圖數(shù)據(jù)格式如下：
Step2. 繪圖數(shù)據(jù)的讀取
data<-read.csv(“your file path”, header = T) #注釋：header=T表示數(shù)據(jù)中的第一行是列名，如果沒有列名就用header=F
Step3. 繪圖所需package的安裝、調(diào)用
library(ggunchained)
library(reshape2)
# 注釋：package使用之前需要調(diào)用
# 注釋：今天用的ggunchained是ggplot2一個拓展包，今天要用的函數(shù)geom_split_violin()需要調(diào)用這個包，
# ggunchained安裝語句： library(devtools) install_github("JanCoUnchained/ggunchained")
# devtools安裝語句：install. packages("devtools")
Step4. 繪圖
data_melt<-melt(data,id.vars = "Sample") # 注釋：將原始的寬數(shù)據(jù)變成長數(shù)據(jù)，方便畫圖 p<-ggplot(data_melt,aes(x=variable,y=value,fill=Sample))+geom_split_violin() p
Step5. 美化
p<-ggplot(data_melt,aes(x=variable,y=value,fill=Sample))+geom_split_violin()+
scale_fill_manual(values = c("#7697CB","#D293C1"))+
theme_bw()
p
其實今天的畫圖語句也比較簡單，關鍵就是找到了合適的包以及函數(shù)，這就不得不贊一下開源軟件R的優(yōu)勢，對于初學者非常友好，不需要精通編程也可以做成很多事情。
對圖片質(zhì)量要求比較高、想讓小提琴圖取消變平滑的朋友，可以參考我之前的分享《R語言繪圖技巧導出高清圖方法》，今天的分享就到這里啦，更多關于R語言繪圖Split violin plot的資料請關注腳本之家其它相關文章！
相關文章
這篇文章主要介紹了R語言截取變量中指定位置的若干個字符，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧2021-04-04
這篇文章主要介紹了R語言中的PCA分析與可視化的相關資料,本文給大家介紹的非常詳細，對大家的學習或工作具有一定的參考借鑒價值，需要的朋友可以參考下2021-03-03
這篇文章主要介紹了R語言時間序列TAR閾值自回歸模型,本文通過實例代碼給大家介紹的非常詳細，對大家的學習或工作具有一定的參考借鑒價值，需要的朋友可以參考下2021-03-03
對比一元線性回歸,多元線性回歸是用來確定2個或2個以上變量間關系的統(tǒng)計分析方法,下面這篇文章主要給大家介紹了關于R語言多元線性回歸的相關資料,文中通過實例代碼介紹的非常詳細,需要的朋友可以參考下2022-07-07
R語言-進行數(shù)據(jù)的重新編碼(recode)操作
這篇文章主要介紹了R語言-進行數(shù)據(jù)的重新編碼(recode)操作，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧2021-04-04
這篇文章主要介紹了R語言讀寫帶分隔符的文件操作，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧2021-04-04
R語言常用函數(shù)總結梳理(基本對象字符處理?數(shù)學?統(tǒng)計)
這篇文章主要介紹了R語言常用函數(shù)總結梳理(基本對象字符處理?數(shù)學?統(tǒng)計),有需要的朋友可以借鑒參考下,希望能夠有所幫助,祝大家多多進步,早日升職加薪2023-10-10
這篇文章主要介紹了R語言柱狀圖排序和x軸上的標簽傾斜操作，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧2021-04-04
本文主要介紹了R繪制漂亮的中國地圖的實現(xiàn)示例，文中通過示例代碼介紹的非常詳細，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們可以參考一下2021-09-09
這篇文章主要為大家介紹了R語言編程重讀微積分數(shù)學分析理解極限算法的詳細過程，有需要的朋友可以借鑒參考下，希望能夠有所幫助，祝大家多多進步2021-10-10