python 決策樹算法的實(shí)現(xiàn)
更新時(shí)間:2020年10月09日 10:04:04 作者:chenxiangzhen
這篇文章主要介紹了python 決策樹算法的實(shí)現(xiàn),幫助大家更好的理解和使用python 機(jī)器學(xué)習(xí)算法,感興趣的朋友可以了解下
'''
數(shù)據(jù)集:Mnist
訓(xùn)練集數(shù)量:60000
測(cè)試集數(shù)量:10000
------------------------------
運(yùn)行結(jié)果:ID3(未剪枝)
正確率:85.9%
運(yùn)行時(shí)長(zhǎng):356s
'''
import time
import numpy as np
def loadData(fileName):
'''
加載文件
:param fileName:要加載的文件路徑
:return: 數(shù)據(jù)集和標(biāo)簽集
'''
# 存放數(shù)據(jù)及標(biāo)記
dataArr = [];
labelArr = []
# 讀取文件
fr = open(fileName)
# 遍歷文件中的每一行
for line in fr.readlines():
# 獲取當(dāng)前行,并按“,”切割成字段放入列表中
# strip:去掉每行字符串首尾指定的字符(默認(rèn)空格或換行符)
# split:按照指定的字符將字符串切割成每個(gè)字段,返回列表形式
curLine = line.strip().split(',')
# 將每行中除標(biāo)記外的數(shù)據(jù)放入數(shù)據(jù)集中(curLine[0]為標(biāo)記信息)
# 在放入的同時(shí)將原先字符串形式的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為整型
# 此外將數(shù)據(jù)進(jìn)行了二值化處理,大于128的轉(zhuǎn)換成1,小于的轉(zhuǎn)換成0,方便后續(xù)計(jì)算
dataArr.append([int(int(num) > 128) for num in curLine[1:]])
# 將標(biāo)記信息放入標(biāo)記集中
# 放入的同時(shí)將標(biāo)記轉(zhuǎn)換為整型
labelArr.append(int(curLine[0]))
# 返回?cái)?shù)據(jù)集和標(biāo)記
return dataArr, labelArr
def majorClass(labelArr):
'''
找到當(dāng)前標(biāo)簽集中占數(shù)目最大的標(biāo)簽
:param labelArr: 標(biāo)簽集
:return: 最大的標(biāo)簽
'''
# 建立字典,用于不同類別的標(biāo)簽技術(shù)
classDict = {}
# 遍歷所有標(biāo)簽
for i in range(len(labelArr)):
# 當(dāng)?shù)谝淮斡龅紸標(biāo)簽時(shí),字典內(nèi)還沒(méi)有A標(biāo)簽,這時(shí)候直接幅值加1是錯(cuò)誤的,
# 所以需要判斷字典中是否有該鍵,沒(méi)有則創(chuàng)建,有就直接自增
if labelArr[i] in classDict.keys():
# 若在字典中存在該標(biāo)簽,則直接加1
classDict[labelArr[i]] += 1
else:
# 若無(wú)該標(biāo)簽,設(shè)初值為1,表示出現(xiàn)了1次了
classDict[labelArr[i]] = 1
# 對(duì)字典依據(jù)值進(jìn)行降序排序
classSort = sorted(classDict.items(), key=lambda x: x[1], reverse=True)
# 返回最大一項(xiàng)的標(biāo)簽,即占數(shù)目最多的標(biāo)簽
return classSort[0][0]
def calc_H_D(trainLabelArr):
'''
計(jì)算數(shù)據(jù)集D的經(jīng)驗(yàn)熵,參考公式5.7 經(jīng)驗(yàn)熵的計(jì)算
:param trainLabelArr:當(dāng)前數(shù)據(jù)集的標(biāo)簽集
:return: 經(jīng)驗(yàn)熵
'''
# 初始化為0
H_D = 0
# 將當(dāng)前所有標(biāo)簽放入集合中,這樣只要有的標(biāo)簽都會(huì)在集合中出現(xiàn),且出現(xiàn)一次。
# 遍歷該集合就可以遍歷所有出現(xiàn)過(guò)的標(biāo)記并計(jì)算其Ck
# 這么做有一個(gè)很重要的原因:首先假設(shè)一個(gè)背景,當(dāng)前標(biāo)簽集中有一些標(biāo)記已經(jīng)沒(méi)有了,比如說(shuō)標(biāo)簽集中
# 沒(méi)有0(這是很正常的,說(shuō)明當(dāng)前分支不存在這個(gè)標(biāo)簽)。 式5.7中有一項(xiàng)Ck,那按照式中的針對(duì)不同標(biāo)簽k
# 計(jì)算Cl和D并求和時(shí),由于沒(méi)有0,那么C0=0,此時(shí)C0/D0=0,log2(C0/D0) = log2(0),事實(shí)上0并不在log的
# 定義區(qū)間內(nèi),出現(xiàn)了問(wèn)題
# 所以使用集合的方式先知道當(dāng)前標(biāo)簽中都出現(xiàn)了那些標(biāo)簽,隨后對(duì)每個(gè)標(biāo)簽進(jìn)行計(jì)算,如果沒(méi)出現(xiàn)的標(biāo)簽?zāi)且豁?xiàng)就
# 不在經(jīng)驗(yàn)熵中出現(xiàn)(未參與,對(duì)經(jīng)驗(yàn)熵?zé)o影響),保證log的計(jì)算能一直有定義
trainLabelSet = set([label for label in trainLabelArr])
# 遍歷每一個(gè)出現(xiàn)過(guò)的標(biāo)簽
for i in trainLabelSet:
# 計(jì)算|Ck|/|D|
# trainLabelArr == i:當(dāng)前標(biāo)簽集中為該標(biāo)簽的的位置
# 例如a = [1, 0, 0, 1], c = (a == 1): c == [True, false, false, True]
# trainLabelArr[trainLabelArr == i]:獲得為指定標(biāo)簽的樣本
# trainLabelArr[trainLabelArr == i].size:獲得為指定標(biāo)簽的樣本的大小,即標(biāo)簽為i的樣本
# 數(shù)量,就是|Ck|
# trainLabelArr.size:整個(gè)標(biāo)簽集的數(shù)量(也就是樣本集的數(shù)量),即|D|
p = trainLabelArr[trainLabelArr == i].size / trainLabelArr.size
# 對(duì)經(jīng)驗(yàn)熵的每一項(xiàng)累加求和
H_D += -1 * p * np.log2(p)
# 返回經(jīng)驗(yàn)熵
return H_D
def calcH_D_A(trainDataArr_DevFeature, trainLabelArr):
'''
計(jì)算經(jīng)驗(yàn)條件熵
:param trainDataArr_DevFeature:切割后只有feature那列數(shù)據(jù)的數(shù)組
:param trainLabelArr: 標(biāo)簽集數(shù)組
:return: 經(jīng)驗(yàn)條件熵
'''
# 初始為0
H_D_A = 0
# 在featue那列放入集合中,是為了根據(jù)集合中的數(shù)目知道該feature目前可取值數(shù)目是多少
trainDataSet = set([label for label in trainDataArr_DevFeature])
# 對(duì)于每一個(gè)特征取值遍歷計(jì)算條件經(jīng)驗(yàn)熵的每一項(xiàng)
for i in trainDataSet:
# 計(jì)算H(D|A)
# trainDataArr_DevFeature[trainDataArr_DevFeature == i].size / trainDataArr_DevFeature.size:|Di| / |D|
# calc_H_D(trainLabelArr[trainDataArr_DevFeature == i]):H(Di)
H_D_A += trainDataArr_DevFeature[trainDataArr_DevFeature == i].size / trainDataArr_DevFeature.size \
* calc_H_D(trainLabelArr[trainDataArr_DevFeature == i])
# 返回得出的條件經(jīng)驗(yàn)熵
return H_D_A
def calcBestFeature(trainDataList, trainLabelList):
'''
計(jì)算信息增益最大的特征
:param trainDataList: 當(dāng)前數(shù)據(jù)集
:param trainLabelList: 當(dāng)前標(biāo)簽集
:return: 信息增益最大的特征及最大信息增益值
'''
# 將數(shù)據(jù)集和標(biāo)簽集轉(zhuǎn)換為數(shù)組形式
# trainLabelArr轉(zhuǎn)換后需要轉(zhuǎn)置,這樣在取數(shù)時(shí)方便
# 例如a = np.array([1, 2, 3]); b = np.array([1, 2, 3]).T
# 若不轉(zhuǎn)置,a[0] = [1, 2, 3],轉(zhuǎn)置后b[0] = 1, b[1] = 2
# 對(duì)于標(biāo)簽集來(lái)說(shuō),能夠很方便地取到每一位是很重要的
trainDataArr = np.array(trainDataList)
trainLabelArr = np.array(trainLabelList).T
# 獲取當(dāng)前特征數(shù)目,也就是數(shù)據(jù)集的橫軸大小
featureNum = trainDataArr.shape[1]
# 初始化最大信息增益
maxG_D_A = -1
# 初始化最大信息增益的特征
maxFeature = -1
# 對(duì)每一個(gè)特征進(jìn)行遍歷計(jì)算
for feature in range(featureNum):
# “5.2.2 信息增益”中“算法5.1(信息增益的算法)”第一步:
# 1.計(jì)算數(shù)據(jù)集D的經(jīng)驗(yàn)熵H(D)
H_D = calc_H_D(trainLabelArr)
# 2.計(jì)算條件經(jīng)驗(yàn)熵H(D|A)
# 由于條件經(jīng)驗(yàn)熵的計(jì)算過(guò)程中只涉及到標(biāo)簽以及當(dāng)前特征,為了提高運(yùn)算速度(全部樣本
# 做成的矩陣運(yùn)算速度太慢,需要剔除不需要的部分),將數(shù)據(jù)集矩陣進(jìn)行切割
# 數(shù)據(jù)集在初始時(shí)刻是一個(gè)Arr = 60000*784的矩陣,針對(duì)當(dāng)前要計(jì)算的feature,在訓(xùn)練集中切割下
# Arr[:, feature]這么一條來(lái),因?yàn)楹罄m(xù)計(jì)算中數(shù)據(jù)集中只用到這個(gè)(沒(méi)明白的跟著算一遍例5.2)
# trainDataArr[:, feature]:在數(shù)據(jù)集中切割下這么一條
# trainDataArr[:, feature].flat:將這么一條轉(zhuǎn)換成豎著的列表
# np.array(trainDataArr[:, feature].flat):再轉(zhuǎn)換成一條豎著的矩陣,大小為60000*1(只是初始是
# 這么大,運(yùn)行過(guò)程中是依據(jù)當(dāng)前數(shù)據(jù)集大小動(dòng)態(tài)變的)
trainDataArr_DevideByFeature = np.array(trainDataArr[:, feature].flat)
# 3.計(jì)算信息增益G(D|A) G(D|A) = H(D) - H(D | A)
G_D_A = H_D - calcH_D_A(trainDataArr_DevideByFeature, trainLabelArr)
# 不斷更新最大的信息增益以及對(duì)應(yīng)的feature
if G_D_A > maxG_D_A:
maxG_D_A = G_D_A
maxFeature = feature
return maxFeature, maxG_D_A
def getSubDataArr(trainDataArr, trainLabelArr, A, a):
'''
更新數(shù)據(jù)集和標(biāo)簽集
:param trainDataArr:要更新的數(shù)據(jù)集
:param trainLabelArr: 要更新的標(biāo)簽集
:param A: 要去除的特征索引
:param a: 當(dāng)data[A]== a時(shí),說(shuō)明該行樣本時(shí)要保留的
:return: 新的數(shù)據(jù)集和標(biāo)簽集
'''
# 返回的數(shù)據(jù)集
retDataArr = []
# 返回的標(biāo)簽集
retLabelArr = []
# 對(duì)當(dāng)前數(shù)據(jù)的每一個(gè)樣本進(jìn)行遍歷
for i in range(len(trainDataArr)):
# 如果當(dāng)前樣本的特征為指定特征值a
if trainDataArr[i][A] == a:
# 那么將該樣本的第A個(gè)特征切割掉,放入返回的數(shù)據(jù)集中
retDataArr.append(trainDataArr[i][0:A] + trainDataArr[i][A + 1:])
# 將該樣本的標(biāo)簽放入返回標(biāo)簽集中
retLabelArr.append(trainLabelArr[i])
# 返回新的數(shù)據(jù)集和標(biāo)簽集
return retDataArr, retLabelArr
def createTree(*dataSet):
'''
遞歸創(chuàng)建決策樹
:param dataSet:(trainDataList, trainLabelList) <<-- 元祖形式
:return:新的子節(jié)點(diǎn)或該葉子節(jié)點(diǎn)的值
'''
# 設(shè)置Epsilon,“5.3.1 ID3算法”第4步提到需要將信息增益與閾值Epsilon比較,若小于則直接處理后返回T
Epsilon = 0.1
# 從參數(shù)中獲取trainDataList和trainLabelList
trainDataList = dataSet[0][0]
trainLabelList = dataSet[0][1]
# 打印信息:開始一個(gè)子節(jié)點(diǎn)創(chuàng)建,打印當(dāng)前特征向量數(shù)目及當(dāng)前剩余樣本數(shù)目
print('start a node', len(trainDataList[0]), len(trainLabelList))
# 將標(biāo)簽放入一個(gè)字典中,當(dāng)前樣本有多少類,在字典中就會(huì)有多少項(xiàng)
# 也相當(dāng)于去重,多次出現(xiàn)的標(biāo)簽就留一次。舉個(gè)例子,假如處理結(jié)束后字典的長(zhǎng)度為1,那說(shuō)明所有的樣本
# 都是同一個(gè)標(biāo)簽,那就可以直接返回該標(biāo)簽了,不需要再生成子節(jié)點(diǎn)了。
classDict = {i for i in trainLabelList}
# 如果D中所有實(shí)例屬于同一類Ck,則置T為單節(jié)點(diǎn)數(shù),并將Ck作為該節(jié)點(diǎn)的類,返回T
# 即若所有樣本的標(biāo)簽一致,也就不需要再分化,返回標(biāo)記作為該節(jié)點(diǎn)的值,返回后這就是一個(gè)葉子節(jié)點(diǎn)
if len(classDict) == 1:
# 因?yàn)樗袠颖径际且恢碌模跇?biāo)簽集中隨便拿一個(gè)標(biāo)簽返回都行,這里用的第0個(gè)(因?yàn)槟悴⒉恢?
# 當(dāng)前標(biāo)簽集的長(zhǎng)度是多少,但運(yùn)行中所有標(biāo)簽只要有長(zhǎng)度都會(huì)有第0位。
return trainLabelList[0]
# 如果A為空集,則置T為單節(jié)點(diǎn)數(shù),并將D中實(shí)例數(shù)最大的類Ck作為該節(jié)點(diǎn)的類,返回T
# 即如果已經(jīng)沒(méi)有特征可以用來(lái)再分化了,就返回占大多數(shù)的類別
if len(trainDataList[0]) == 0:
# 返回當(dāng)前標(biāo)簽集中占數(shù)目最大的標(biāo)簽
return majorClass(trainLabelList)
# 否則,按式5.10計(jì)算A中個(gè)特征值的信息增益,選擇信息增益最大的特征Ag
Ag, EpsilonGet = calcBestFeature(trainDataList, trainLabelList)
# 如果Ag的信息增益比小于閾值Epsilon,則置T為單節(jié)點(diǎn)樹,并將D中實(shí)例數(shù)最大的類Ck
# 作為該節(jié)點(diǎn)的類,返回T
if EpsilonGet < Epsilon:
return majorClass(trainLabelList)
# 否則,對(duì)Ag的每一可能值ai,依Ag=ai將D分割為若干非空子集Di,將Di中實(shí)例數(shù)最大的
# 類作為標(biāo)記,構(gòu)建子節(jié)點(diǎn),由節(jié)點(diǎn)及其子節(jié)點(diǎn)構(gòu)成樹T,返回T
treeDict = {Ag: {}}
# 特征值為0時(shí),進(jìn)入0分支
# getSubDataArr(trainDataList, trainLabelList, Ag, 0):在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中切割當(dāng)前feature,返回新的數(shù)據(jù)集和標(biāo)簽集
treeDict[Ag][0] = createTree(getSubDataArr(trainDataList, trainLabelList, Ag, 0))
treeDict[Ag][1] = createTree(getSubDataArr(trainDataList, trainLabelList, Ag, 1))
return treeDict
def predict(testDataList, tree):
'''
預(yù)測(cè)標(biāo)簽
:param testDataList:樣本
:param tree: 決策樹
:return: 預(yù)測(cè)結(jié)果
'''
# treeDict = copy.deepcopy(tree)
# 死循環(huán),直到找到一個(gè)有效地分類
while True:
# 因?yàn)橛袝r(shí)候當(dāng)前字典只有一個(gè)節(jié)點(diǎn)
# 例如{73: {0: {74:6}}}看起來(lái)節(jié)點(diǎn)很多,但是對(duì)于字典的最頂層來(lái)說(shuō),只有73一個(gè)key,其余都是value
# 若還是采用for來(lái)讀取的話不太合適,所以使用下行這種方式讀取key和value
(key, value), = tree.items()
# 如果當(dāng)前的value是字典,說(shuō)明還需要遍歷下去
if type(tree[key]).__name__ == 'dict':
# 獲取目前所在節(jié)點(diǎn)的feature值,需要在樣本中刪除該feature
# 因?yàn)樵趧?chuàng)建樹的過(guò)程中,feature的索引值永遠(yuǎn)是對(duì)于當(dāng)時(shí)剩余的feature來(lái)設(shè)置的
# 所以需要不斷地刪除已經(jīng)用掉的特征,保證索引相對(duì)位置的一致性
dataVal = testDataList[key]
del testDataList[key]
# 將tree更新為其子節(jié)點(diǎn)的字典
tree = value[dataVal]
# 如果當(dāng)前節(jié)點(diǎn)的子節(jié)點(diǎn)的值是int,就直接返回該int值
# 例如{403: {0: 7, 1: {297:7}},dataVal=0
# 此時(shí)上一行tree = value[dataVal],將tree定位到了7,而7不再是一個(gè)字典了,
# 這里就可以直接返回7了,如果tree = value[1],那就是一個(gè)新的子節(jié)點(diǎn),需要繼續(xù)遍歷下去
if type(tree).__name__ == 'int':
# 返回該節(jié)點(diǎn)值,也就是分類值
return tree
else:
# 如果當(dāng)前value不是字典,那就返回分類值
return value
def accuracy(testDataList, testLabelList, tree):
'''
測(cè)試準(zhǔn)確率
:param testDataList:待測(cè)試數(shù)據(jù)集
:param testLabelList: 待測(cè)試標(biāo)簽集
:param tree: 訓(xùn)練集生成的樹
:return: 準(zhǔn)確率
'''
# 錯(cuò)誤次數(shù)計(jì)數(shù)
errorCnt = 0
# 遍歷測(cè)試集中每一個(gè)測(cè)試樣本
for i in range(len(testDataList)):
# 判斷預(yù)測(cè)與標(biāo)簽中結(jié)果是否一致
if testLabelList[i] != predict(testDataList[i], tree):
errorCnt += 1
# 返回準(zhǔn)確率
return 1 - errorCnt / len(testDataList)
if __name__ == '__main__':
# 開始時(shí)間
start = time.time()
# 獲取訓(xùn)練集
trainDataList, trainLabelList = loadData('../Mnist/mnist_train.csv')
# 獲取測(cè)試集
testDataList, testLabelList = loadData('../Mnist/mnist_test.csv')
# 創(chuàng)建決策樹
print('start create tree')
tree = createTree((trainDataList, trainLabelList))
print('tree is:', tree)
# 測(cè)試準(zhǔn)確率
print('start test')
accur = accuracy(testDataList, testLabelList, tree)
print('the accur is:', accur)
# 結(jié)束時(shí)間
end = time.time()
print('time span:', end - start)
以上就是python 決策樹算法的實(shí)現(xiàn)的詳細(xì)內(nèi)容,更多關(guān)于python 決策樹算法的資料請(qǐng)關(guān)注腳本之家其它相關(guān)文章!
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