python實現(xiàn)PCA降維的示例詳解
概述
本文主要介紹一種降維方法,PCA(Principal Component Analysis,主成分分析)。降維致力于解決三類問題。
1. 降維可以緩解維度災難問題;
2. 降維可以在壓縮數(shù)據(jù)的同時讓信息損失最小化;
3. 理解幾百個維度的數(shù)據(jù)結構很困難,兩三個維度的數(shù)據(jù)通過可視化更容易理解。
PCA簡介
在理解特征提取與處理時,涉及高維特征向量的問題往往容易陷入維度災難。隨著數(shù)據(jù)集維度的增加,算法學習需要的樣本數(shù)量呈指數(shù)級增加。有些應用中,遇到這樣的大數(shù)據(jù)是非常不利的,而且從大數(shù)據(jù)集中學習需要更多的內(nèi)存和處理能力。另外,隨著維度的增加,數(shù)據(jù)的稀疏性會越來越高。在高維向量空間中探索同樣的數(shù)據(jù)集比在同樣稀疏的數(shù)據(jù)集中探索更加困難。
主成分分析也稱為卡爾胡寧-勒夫變換(Karhunen-Loeve Transform),是一種用于探索高維數(shù)據(jù)結構的技術。PCA通常用于高維數(shù)據(jù)集的探索與可視化。還可以用于數(shù)據(jù)壓縮,數(shù)據(jù)預處理等。PCA可以把可能具有相關性的高維變量合成線性無關的低維變量,稱為主成分( principal components)。新的低維數(shù)據(jù)集會盡可能的保留原始數(shù)據(jù)的變量。
PCA將數(shù)據(jù)投射到一個低維子空間實現(xiàn)降維。例如,二維數(shù)據(jù)集降維就是把點投射成一條線,數(shù)據(jù)集的每個樣本都可以用一個值表示,不需要兩個值。三維數(shù)據(jù)集可以降成二維,就是把變量映射成一個平面。一般情況下,nn維數(shù)據(jù)集可以通過映射降成kk維子空間,其中k≤nk≤n。
假如你是一本養(yǎng)花工具宣傳冊的攝影師,你正在拍攝一個水壺。水壺是三維的,但是照片是二維的,為了更全面的把水壺展示給客戶,你需要從不同角度拍幾張圖片。下圖是你從四個方向拍的照片:

第一張圖里水壺的背面可以看到,但是看不到前面。第二張圖是拍前面,可以看到壺嘴,這張圖可以提供了第一張圖缺失的信息,但是壺把看不到了。從第三張俯視圖里無法看出壺的高度。第四張圖是你真正想要的,水壺的高度,頂部,壺嘴和壺把都清晰可見。
PCA的設計理念與此類似,它可以將高維數(shù)據(jù)集映射到低維空間的同時,盡可能的保留更多變量。PCA旋轉數(shù)據(jù)集與其主成分對齊,將最多的變量保留到第一主成分中。假設我們有下圖所示的數(shù)據(jù)集:

數(shù)據(jù)集看起來像一個從原點到右上角延伸的細長扁平的橢圓。要降低整個數(shù)據(jù)集的維度,我們必須把點映射成一條線。下圖中的兩條線都是數(shù)據(jù)集可以映射的,映射到哪條線樣本變化最大?

顯然,樣本映射到黑色虛線的變化比映射到紅色點線的變化要大的多。實際上,這條黑色虛線就是第一主成分。第二主成分必須與第一主成分正交,也就是說第二主成分必須是在統(tǒng)計學上獨立的,會出現(xiàn)在與第一主成分垂直的方向,如下圖所示:

后面的每個主成分也會盡量多的保留剩下的變量,唯一的要求就是每一個主成分需要和前面的主成分正交。
現(xiàn)在假設數(shù)據(jù)集是三維的,散點圖看起來像是沿著一個軸旋轉的圓盤。

這些點可以通過旋轉和變換使圓盤完全變成二維的?,F(xiàn)在這些點看著像一個橢圓,第三維上基本沒有變量,可以被忽略。
當數(shù)據(jù)集不同維度上的方差分布不均勻的時候,PCA最有用。(如果是一個球殼形數(shù)據(jù)集,PCA不能有效的發(fā)揮作用,因為各個方向上的方差都相等;沒有丟失大量的信息維度一個都不能忽略)。
python實現(xiàn)PCA降維代碼
# coding=utf-8
from sklearn.decomposition import PCA
from pandas.core.frame import DataFrame
import pandas as pd
import numpy as np
l=[]
with open('test.csv','r') as fd:
line= fd.readline()
while line:
if line =="":
continue
line = line.strip()
word = line.split(",")
l.append(word)
line= fd.readline()
data_l=DataFrame(l)
print (data_l)
dataMat = np.array(data_l)
pca_sk = PCA(n_components=2)
newMat = pca_sk.fit_transform(dataMat)
data1 = DataFrame(newMat)
data1.to_csv('test_PCA.csv',index=False,header=False)
以上這篇python實現(xiàn)PCA降維的示例詳解就是小編分享給大家的全部內(nèi)容了,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支持腳本之家。
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