如何利用多核CPU來(lái)加速你的Linux命令(GNU Parallel)
你是否曾經(jīng)有過要計(jì)算一個(gè)非常大的數(shù)據(jù)(幾百GB)的需求?或在里面搜索,或其它操作——一些無(wú)法并行的操作。數(shù)據(jù)專家們,我是在對(duì)你們說。你可能有一個(gè)4核或更多核的CPU,但我們合適的工具,例如 grep, bzip2, wc, awk, sed 等等,都是單線程的,只能使用一個(gè)CPU內(nèi)核。
借用卡通人物Cartman的話,“如何我能使用這些內(nèi)核”?
要想讓Linux命令使用所有的CPU內(nèi)核,我們需要用到GNU Parallel命令,它讓我們所有的CPU內(nèi)核在單機(jī)內(nèi)做神奇的map-reduce操作,當(dāng)然,這還要借助很少用到的–pipes 參數(shù)(也叫做–spreadstdin)。這樣,你的負(fù)載就會(huì)平均分配到各CPU上,真的。
BZIP2
bzip2是比gzip更好的壓縮工具,但它很慢!別折騰了,我們有辦法解決這問題。
以前的做法:
cat bigfile.bin | bzip2 --best > compressedfile.bz2
現(xiàn)在這樣:
cat bigfile.bin | parallel --pipe --recend '' -k bzip2 --best > compressedfile.bz2
尤其是針對(duì)bzip2,GNU parallel在多核CPU上是超級(jí)的快。你一不留神,它就執(zhí)行完成了。
GREP
如果你有一個(gè)非常大的文本文件,以前你可能會(huì)這樣:
grep pattern bigfile.txt
現(xiàn)在你可以這樣:
cat bigfile.txt | parallel --pipe grep 'pattern'
或者這樣:
cat bigfile.txt | parallel --block 10M --pipe grep 'pattern'
這第二種用法使用了 –block 10M參數(shù),這是說每個(gè)內(nèi)核處理1千萬(wàn)行——你可以用這個(gè)參數(shù)來(lái)調(diào)整每個(gè)CUP內(nèi)核處理多少行數(shù)據(jù)。
AWK
下面是一個(gè)用awk命令計(jì)算一個(gè)非常大的數(shù)據(jù)文件的例子。
常規(guī)用法:
cat rands20M.txt | awk '{s+=$1} END {print s}'
現(xiàn)在這樣:
cat rands20M.txt | parallel --pipe awk \'{s+=\$1} END {print s}\' | awk '{s+=$1} END {print s}'
這個(gè)有點(diǎn)復(fù)雜:parallel命令中的–pipe參數(shù)將cat輸出分成多個(gè)塊分派給awk調(diào)用,形成了很多子計(jì)算操作。這些子計(jì)算經(jīng)過第二個(gè)管道進(jìn)入了同一個(gè)awk命令,從而輸出最終結(jié)果。第一個(gè)awk有三個(gè)反斜杠,這是GNU parallel調(diào)用awk的需要。
WC
想要最快的速度計(jì)算一個(gè)文件的行數(shù)嗎?
傳統(tǒng)做法:
wc -l bigfile.txt
現(xiàn)在你應(yīng)該這樣:
cat bigfile.txt | parallel --pipe wc -l | awk '{s+=$1} END {print s}'
非常的巧妙,先使用parallel命令‘mapping'出大量的wc -l調(diào)用,形成子計(jì)算,最后通過管道發(fā)送給awk進(jìn)行匯總。
SED
想在一個(gè)巨大的文件里使用sed命令做大量的替換操作嗎?
常規(guī)做法:
sed s^old^new^g bigfile.txt
現(xiàn)在你可以:
cat bigfile.txt | parallel --pipe sed s^old^new^g
…然后你可以使用管道把輸出存儲(chǔ)到指定的文件里。
以上就是本文的全部?jī)?nèi)容,希望對(duì)大家的學(xué)習(xí)有所幫助,也希望大家多多支持腳本之家。
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