python kmeans聚類簡單介紹和實現(xiàn)代碼
更新時間:2018年02月23日 10:42:39 作者:Jason____zhou
這篇文章主要為大家詳細介紹了python kmeans聚類簡單介紹和實現(xiàn)代碼,具有一定的參考價值,感興趣的小伙伴們可以參考一下
一、k均值聚類的簡單介紹
假設(shè)樣本分為c類,每個類均存在一個中心點,通過隨機生成c個中心點進行迭代,計算每個樣本點到類中心的距離(可以自定義、常用的是歐式距離)
將該樣本點歸入到最短距離所在的類,重新計算聚類中心,進行下次的重新劃分樣本,最終類中心不改變時,聚類完成
二、偽代碼
三、python代碼實現(xiàn)
#!/usr/bin/env python
# coding=utf-8
import numpy as np
import random
import matplotlib.pyplot as plt
#data:numpy.array dataset
#k the number of cluster
def k_means(data,k):
#random generate cluster_center
sample_num=data.shape[0]
center_index=random.sample(range(sample_num),k)
cluster_cen=data[center_index,:]
is_change=1
cat=np.zeros(sample_num)
while is_change:
is_change=0
for i in range(sample_num):
min_distance=100000
min_index=0
for j in range(k):
sub_data=data[i,:]-cluster_cen[j,:]
distance=np.inner(sub_data,sub_data)
if distance<min_distance:
min_distance=distance
min_index=j+1
if cat[i]!=min_index:
is_change=1
cat[i]=min_index
for j in range(k):
cluster_cen[j]=np.mean(data[cat==(j+1)],axis=0)
return cat,cluster_cen
if __name__=='__main__':
#generate data
cov=[[1,0],[0,1]]
mean1=[1,-1]
x1=np.random.multivariate_normal(mean1,cov,200)
mean2=[5.5,-4.5]
x2=np.random.multivariate_normal(mean2,cov,200)
mean3=[1,4]
x3=np.random.multivariate_normal(mean3,cov,200)
mean4=[6,4.5]
x4=np.random.multivariate_normal(mean4,cov,200)
mean5=[9,0.0]
x5=np.random.multivariate_normal(mean5,cov,200)
X=np.vstack((x1,x2,x3,x4,x5))
#data distribution
fig1=plt.figure(1)
p1=plt.scatter(x1[:,0],x1[:,1],marker='o',color='r',label='x1')
p2=plt.scatter(x2[:,0],x2[:,1],marker='+',color='m',label='x2')
p3=plt.scatter(x3[:,0],x3[:,1],marker='x',color='b',label='x3')
p4=plt.scatter(x4[:,0],x4[:,1],marker='*',color='g',label='x4')
p5=plt.scatter(x5[:,0],x4[:,1],marker='+',color='y',label='x5')
plt.title('original data')
plt.legend(loc='upper right')
cat,cluster_cen=k_means(X,5)
print 'the number of cluster 1:',sum(cat==1)
print 'the number of cluster 2:',sum(cat==2)
print 'the number of cluster 3:',sum(cat==3)
print 'the number of cluster 4:',sum(cat==4)
print 'the number of cluster 5:',sum(cat==5)
fig2=plt.figure(2)
for i,m,lo,label in zip(range(5),['o','+','x','*','+'],['r','m','b','g','y'],['x1','x2','x3','x4','x5']):
p=plt.scatter(X[cat==(i+1),0],X[cat==(i+1),1],marker=m,color=lo,label=label)
plt.legend(loc='upper right')
plt.title('the clustering result')
plt.show()
以上就是本文的全部內(nèi)容,希望對大家的學習有所幫助,也希望大家多多支持腳本之家。
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